Fehérje-térszerkezeti illesztőmódszer gyorsítása FPGA technológiával
A februári Budapest Science Meetup-on Goretity Árpád (PPKE - Molekuláris Bionika) fehérje térszerkezetek bioinformatikai módszerekkel történő összehasonlításáról és ezek gyorsításának lehetőségeiről beszélt.
Az előadó összefoglalója:
A modern evolúcióbiológiai és orvostudományi alapkutatás szerves része, nélkülözhetetlen támogatója a bioinformatika. A biológiai adatok számítógépes feldolgozásának gyorsasága lehetővé teszi olyan elemzések, összehasonlítások és szimulációk elvégzését, amelyeket kísérletesen egyáltalán nem, vagy csak nagyon hosszú idő alatt és rendkívül költségesen lehetne megvalósítani. Az egyik legnagyobb horderejű bioinformatikai módszer a fehérjék szerkezeti összehasonlítása. A fehérjék az élő szervezetek alapvető építőkövei, és szerkezetük gyakran összefügg az általuk ellátott feladatokkal, biológiai funkciókkal, így annak a megismerése közvetlenül hasznos, értékes tudáshoz juttatja a kutatókat.
Sajnos a jelenlegi szerkezeti illesztőalgoritmusok jellemzően igen lassúak. Nagyobb fehérjeadatbázisok feldolgozásához tehát új metódusokra van szükség. Egy lehetséges megközelítés a hagyományos számítógépek használata helyett specializált célhardver létrehozása, amelyet munkámban a méltán népszerű FPGA technológiával valósítottam meg. Az eredmények ígéretesek: a célhardvertől akár több nagyságrendbeli gyorsulást, hatékonyságnövekedést is várhatunk.
A címlapi kép forrása: Protein Data Bank/Wikipedia
Lázár: Hatósági intézkedésnek soha nem lehetnek politikai okai, de mi nem vagyunk hülyék
Lázár János szerint jót szoktak nevetni Orbán Viktorral a miniszterelnök testalkatára tett megjegyzésein. Arra pedig, hogy Orbán szerint marhaság volt Gulyás Gergely kijelentése, azt reagálta: a miniszterelnöknek mindig igaza van.
Benéztünk a Fidesz-közeli trollfarmra, a hamis zászlós akció irányítójába botlottunk
A Digitális Demokráciafejlesztési Ügynökség változatos módon segíti a kormánypárt kampányát. A cég egyik regionális vezetőjét, Balog Gézát többek között a DDÜ legemlékezetesebb húzásáról kérdeztük.
Gulyás: Semmilyen módon nem hátráltattam a Fidesz kampányát, sőt
A miniszter szerint „az ég világon semmilyen kritikát” nem kapott a párttárasaitól arra a mondatára, hogy a kormány Trump kérésére megfontolná, hogy segítsünk a Hormuzi-szoros felszabadításában.
Hősök terei óriáskoncerttel hangolnak a sorsdöntő választásra – mi ezzel a cél?
Hétfői vendégünk Puzsér Róbert, aki a Rendszerbontó Nagykoncert újabb fellépőit is bejelenti.
Gulyás marhasága és Matolcsy vécéje megborította a kampányt
Krézi tempóban érkeztünk meg a kampányfinisbe. A hamiszászlós héten Orbán olyat csinált, amit 16 éve nem láttunk tőle. Magyar Péter lecsapott Gulyás Gergely MZP-pillanatára, Kocsis Máté pedig már börtönt emleget Matolcsy Ádámékkal kapcsolatban.