Az MTA után az alternatív iskoláknak megy neki a miniszter. Csak az maradhatna, amelyiknek az oktatási miniszter ezt szubjektív döntése alapján megengedi.
Egy olyan módosítást nyomott be az EMMI az utolsó pillanatban, ami több alternatív iskolát egyszerűen kicsinálna, miközben elvileg nincs konfliktus és az államtitkár is azt állítja, hogy nem kormányzati szándék a megsemmisítésük.